Głównym przecinikiem będzie Billy Russo, a.k.a. Jigsaw. W komiksie był to bandytą mafijnej rodziny Maggia, w filmie będzie pracował dla swojego wuja Gaitano Cesere - poruszjącego się na wózku, związanego z donem mafii, którym Billy otwarcie pogardza (ze wzajemnością). Jigsaw zajmuje się dokami w Nowym Jorku, a jego oszpecenia to pozostałości roboty Punishera.

Jigsaw spodziewa się dochodowego "biologicznego" transportu od rumuńskiego szefa świata przestępczego, Cristu Bulata. Do Cesere'a dochodzą pogłoski o umowie, podejrzewa on, że Jigsaw chce sprzedać towar dla muzułmańskiej komórki terrorystycznej w Queens. To nie jest jedyny wątek z Jigsawem.

Frank Castle, cały czas działa po za prawem, ale NYPD nie są zbytnio chętni by go złapać, zwłaszcza od momentu gdy pomaga im uwolnić ulice od szumowin. Polowanie na Punishera podgrzewa się gdy agent FBI Luke McDonald zostaje wyznaczony do sprawy Castle'a. Luke ma opsesję na punkcie złapania Franka z bardzo osobistych powodów. Luke'owi parteneruje detyktyw z NYPD, zapijaczony Martin Soap.

Okazuje się, że podczas jednej ze swoich operacji Punisher przypadkowo zabił byłego partnera McDonalda, tajnego agenta FBI Nicka Donateliego. (Ale to nie jest jedyny powód vendetty Luke'a) Frank jest pełen wyrzutów sumienia po śmierci agenta, ale nie rezygnuje ze swojej misji.

Ten ciężki temat pokuty jest prowadzony przez sojusznika Franka, Dantego, byłego hulaki i ex-con, który wykorzystał swoje schowane na poźniej pieniądze, by otworzyć legalny interes (arkada w Harlemie), dla rodzin i opiekunów.

Różne wątki zbiegają się gdy celem Jigsawa staje się wdowa po Donatelim, Angie i jej dzecko Gracie. Trzymanie zakładników sprowadza policjantów i Franka. Jigsawowi także się zdarza budowanie armii wilo etnicznych przestępców, których celem  jest likwidacja Punishera. Jest także biologiczna dostawa, którą Punisher musi powstrzymać.

Źródło: IGN